Ломоносов, Жуковский, Войно-Ясневский и т.д. по твоему не мыслили.
Пример с Ломоносовым не совсем корректный:
1. Можно ли было человеку XVIII, жившему в России, свободно выбирать, верить или не верить, если всего лишь за 20 лет до Ломоносова в Москве сжигали за ересь?
2. Смог ли Ломоносов вообще чего-либо добиться, если бы вдруг придерживался атеистических возрений?
3. Были ли хоть как-то в свободном виде в России того времени распространены атеистические взгляды?
Но даже при всем при этом у Ломоносова были весьма своеобразные отношения с церквью, например из его биографии:
1739 — в феврале женился на дочери квартирной хозяйки Елизавете-Христине Циль
1739 — 8 ноября родилась дочь; 9 ноября — крещена в церкви реформатской общины с именем Екатерина-Елизавета.
1740 — 26 мая обвенчался в церкви реформатской общины Марбурга с Елизаветой-Христиной Цильх.
Т.е. вначале женился, потом появился ребенок и только после этого Ломоносов обвенчался в
протестанской церкви. Своебразный поступок для истинного православного.
Можно также вспомнить весьма сложные отношения Ломоносова с Синодом, при попытках его противодействовать обскурантизму.